Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms