Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms