Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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