Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms