Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SRRM4A7MD48 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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