Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRM4A7MD48 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRRM4A7MD48 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SRRM4A7MD48 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRM4A7MD48 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRM4A7MD48 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRM4A7MD48 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRRM4A7MD48 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRRM4A7MD48 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRRM4A7MD48 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRRM4A7MD48 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRRM4A7MD48 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRRM4A7MD48 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRRM4A7MD48 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRM4A7MD48 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRM4A7MD48 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRM4A7MD48 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRM4A7MD48 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRM4A7MD48 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRM4A7MD48 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRM4A7MD48 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRRM4A7MD48 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRM4A7MD48 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRM4A7MD48 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRM4A7MD48 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRM4A7MD48 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRM4A7MD48 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRRM4A7MD48 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRM4A7MD48 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRRM4A7MD48 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRRM4A7MD48 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRM4A7MD48 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRM4A7MD48 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRM4A7MD48 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRM4A7MD48 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM4A7MD48 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM4A7MD48 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRM4A7MD48 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRM4A7MD48 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM4A7MD48 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM4A7MD48 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRM4A7MD48 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRM4A7MD48 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRM4A7MD48 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRM4A7MD48 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM4A7MD48 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM4A7MD48 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM4A7MD48 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM4A7MD48 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM4A7MD48 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM4A7MD48 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRM4A7MD48 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRM4A7MD48 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRM4A7MD48 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRM4A7MD48 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRM4A7MD48 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRM4A7MD48 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRRM4A7MD48 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRRM4A7MD48 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM4A7MD48 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRRM4A7MD48 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRM4A7MD48 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRM4A7MD48 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRM4A7MD48 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM4A7MD48 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM4A7MD48 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRM4A7MD48 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRM4A7MD48 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRM4A7MD48 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRRM4A7MD48 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRRM4A7MD48 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRRM4A7MD48 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRRM4A7MD48 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRRM4A7MD48 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRRM4A7MD48 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SRRM4A7MD48 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRRM4A7MD48 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRRM4A7MD48 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM4A7MD48 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRRM4A7MD48 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRRM4A7MD48 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRRM4A7MD48 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRRM4A7MD48 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRM4A7MD48 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRRM4A7MD48 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRRM4A7MD48 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM4A7MD48 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRM4A7MD48 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRM4A7MD48 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRM4A7MD48 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM4A7MD48 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM4A7MD48 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRM4A7MD48 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRM4A7MD48 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRM4A7MD48 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRM4A7MD48 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRM4A7MD48 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRRM4A7MD48 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM4A7MD48 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRRM4A7MD48 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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