Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGAEP38570 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms