Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms