Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms