Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

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Length 740 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LRRN4Q8WUT4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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