Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KIR2DL4-205ENST00000396284 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CD300LF-201ENST00000301573 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CD300LF-202ENST00000326165 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PRAMEF9-201ENST00000415919 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF169-202ENST00000395395 1986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF9-218ENST00000624843 2154 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT10B-201ENST00000297994 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAN1C1-202ENST00000374329 2461 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL355482.1-201ENST00000411509 2463 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R1A-202ENST00000547431 2491 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LILRB2-203ENST00000391748 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF559-213ENST00000603380 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMC2-201ENST00000358864 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CTCFL-202ENST00000371196 3491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL590438.1-201ENST00000607061 3461 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC12A4-204ENST00000541864 3627 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF839-209ENST00000559185 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CSF3R-202ENST00000361632 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TKTL1-202ENST00000369915 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01907-201ENST00000415174 2609 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SEC14L1-203ENST00000431431 2504 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC023449.2-201ENST00000620538 2400 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM19-201ENST00000358777 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEC3-201ENST00000298296 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms