Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTCH1Q13635 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTCH1Q13635 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTCH1Q13635 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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