Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZBED1O96006 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZBED1O96006 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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