Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms