Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CNTNAP3Q9BZ76 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CNTNAP3Q9BZ76 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CNTNAP3Q9BZ76 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CNTNAP3Q9BZ76 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CNTNAP3Q9BZ76 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CNTNAP3Q9BZ76 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CNTNAP3Q9BZ76 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNTNAP3Q9BZ76 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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