Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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SIX1Q15475 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SIX1Q15475 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SIX1Q15475 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SIX1Q15475 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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