RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556072.2

VASH1-AS1-202, VASH1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VASH1-AS1, Length 1,684 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASH1-AS1-202ENST00000556072 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.13■■■□□ 2.73
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.26■■■□□ 2.11
VASH1-AS1-202ENST00000556072 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
VASH1-AS1-202ENST00000556072 ABCC9O60706 1549 aa26.83■■□□□ 1.89
VASH1-AS1-202ENST00000556072 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.61■■□□□ 1.85
VASH1-AS1-202ENST00000556072 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.57■■□□□ 1.84
VASH1-AS1-202ENST00000556072 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.4■■□□□ 1.82
VASH1-AS1-202ENST00000556072 NACADO15069 1562 aa26.34■■□□□ 1.81
VASH1-AS1-202ENST00000556072 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.19■■□□□ 1.78
VASH1-AS1-202ENST00000556072 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.95■■□□□ 1.74
VASH1-AS1-202ENST00000556072 SCRIBQ14160 1630 aa25.87■■□□□ 1.73
VASH1-AS1-202ENST00000556072 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.64■■□□□ 1.7
VASH1-AS1-202ENST00000556072 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.31■■□□□ 1.64
VASH1-AS1-202ENST00000556072 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.92■■□□□ 1.58
VASH1-AS1-202ENST00000556072 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
VASH1-AS1-202ENST00000556072 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
VASH1-AS1-202ENST00000556072 SMARCA4P51532 1647 aa24.79■■□□□ 1.56
VASH1-AS1-202ENST00000556072 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.78■■□□□ 1.56
VASH1-AS1-202ENST00000556072 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
VASH1-AS1-202ENST00000556072 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
VASH1-AS1-202ENST00000556072 WIZO95785 1651 aa24.6■■□□□ 1.53
VASH1-AS1-202ENST00000556072 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.5■■□□□ 1.51
VASH1-AS1-202ENST00000556072 SMARCA2P51531 1590 aa24.46■■□□□ 1.51
VASH1-AS1-202ENST00000556072 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.4■■□□□ 1.5
VASH1-AS1-202ENST00000556072 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.31■■□□□ 1.48
VASH1-AS1-202ENST00000556072 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
VASH1-AS1-202ENST00000556072 HMGXB3Q12766 1538 aa24.25■■□□□ 1.47
VASH1-AS1-202ENST00000556072 NCAPD3P42695 1498 aa24.25■■□□□ 1.47
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.06■■□□□ 1.44
VASH1-AS1-202ENST00000556072 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.79■■□□□ 1.4
VASH1-AS1-202ENST00000556072 PRDM2Q13029 1718 aa23.64■■□□□ 1.38
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CFTRP13569 1480 aa23.63■■□□□ 1.37
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.63■■□□□ 1.37
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.6■■□□□ 1.37
VASH1-AS1-202ENST00000556072 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.53■■□□□ 1.36
VASH1-AS1-202ENST00000556072 ABCC8Q09428 1581 aa23.47■■□□□ 1.35
VASH1-AS1-202ENST00000556072 NESP48681 1621 aa23.45■■□□□ 1.34
VASH1-AS1-202ENST00000556072 TRIM41Q8WV44 630 aa23.42■■□□□ 1.34
VASH1-AS1-202ENST00000556072 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
VASH1-AS1-202ENST00000556072 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.36■■□□□ 1.33
VASH1-AS1-202ENST00000556072 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.33■■□□□ 1.33
VASH1-AS1-202ENST00000556072 SYNJ1O43426 1573 aa23.29■■□□□ 1.32
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.27■■□□□ 1.32
VASH1-AS1-202ENST00000556072 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.26■■□□□ 1.31
VASH1-AS1-202ENST00000556072 TOP2BQ02880 1626 aa23.25■■□□□ 1.31
VASH1-AS1-202ENST00000556072 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.25■■□□□ 1.31
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CUX1P39880 1505 aa23.2■■□□□ 1.31
VASH1-AS1-202ENST00000556072 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.14■■□□□ 1.3
VASH1-AS1-202ENST00000556072 ERCC6Q03468 1493 aa23.1■■□□□ 1.29
VASH1-AS1-202ENST00000556072 TOPBP1Q92547 1522 aa23.08■■□□□ 1.29
VASH1-AS1-202ENST00000556072 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
VASH1-AS1-202ENST00000556072 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.05■■□□□ 1.28
VASH1-AS1-202ENST00000556072 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.02■■□□□ 1.28
VASH1-AS1-202ENST00000556072 EEA1Q15075 1411 aa22.95■■□□□ 1.26
VASH1-AS1-202ENST00000556072 WDR62O43379 1518 aa22.94■■□□□ 1.26
VASH1-AS1-202ENST00000556072 SOGA1O94964 1423 aa22.94■■□□□ 1.26
VASH1-AS1-202ENST00000556072 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
VASH1-AS1-202ENST00000556072 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VASH1-AS1-202ENST00000556072 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VASH1-AS1-202ENST00000556072 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.85■■□□□ 1.25
VASH1-AS1-202ENST00000556072 KIF27Q86VH2 1401 aa22.84■■□□□ 1.25
VASH1-AS1-202ENST00000556072 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.83■■□□□ 1.24
VASH1-AS1-202ENST00000556072 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.82■■□□□ 1.24
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CUX2O14529 1486 aa22.81■■□□□ 1.24
VASH1-AS1-202ENST00000556072 WDR97A6NE52 1622 aa22.81■■□□□ 1.24
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.77■■□□□ 1.24
VASH1-AS1-202ENST00000556072 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
VASH1-AS1-202ENST00000556072 IFT140Q96RY7 1462 aa22.73■■□□□ 1.23
VASH1-AS1-202ENST00000556072 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.67■■□□□ 1.22
VASH1-AS1-202ENST00000556072 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.67■■□□□ 1.22
VASH1-AS1-202ENST00000556072 KIF21BO75037 1637 aa22.67■■□□□ 1.22
VASH1-AS1-202ENST00000556072 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
VASH1-AS1-202ENST00000556072 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.61■■□□□ 1.21
VASH1-AS1-202ENST00000556072 GOLGA3Q08378 1498 aa22.6■■□□□ 1.21
VASH1-AS1-202ENST00000556072 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.6■■□□□ 1.21
VASH1-AS1-202ENST00000556072 PBRM1Q86U86 1689 aa22.59■■□□□ 1.21
VASH1-AS1-202ENST00000556072 IGF1RP08069 1367 aa22.58■■□□□ 1.21
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CUL7Q14999 1698 aa22.57■■□□□ 1.2
VASH1-AS1-202ENST00000556072 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.57■■□□□ 1.2
VASH1-AS1-202ENST00000556072 PRXQ9BXM0 1461 aa22.57■■□□□ 1.2
VASH1-AS1-202ENST00000556072 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
VASH1-AS1-202ENST00000556072 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
VASH1-AS1-202ENST00000556072 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
VASH1-AS1-202ENST00000556072 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.51■■□□□ 1.19
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.5■■□□□ 1.19
VASH1-AS1-202ENST00000556072 GRIN2BQ13224 1484 aa22.5■■□□□ 1.19
VASH1-AS1-202ENST00000556072 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
VASH1-AS1-202ENST00000556072 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.44■■□□□ 1.18
VASH1-AS1-202ENST00000556072 ADAMTS12P58397 1594 aa22.41■■□□□ 1.18
VASH1-AS1-202ENST00000556072 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.37■■□□□ 1.17
VASH1-AS1-202ENST00000556072 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.36■■□□□ 1.17
VASH1-AS1-202ENST00000556072 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CEP162Q5TB80 1403 aa22.31■■□□□ 1.16
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.3■■□□□ 1.16
VASH1-AS1-202ENST00000556072 SYNJ2O15056 1496 aa22.25■■□□□ 1.15
VASH1-AS1-202ENST00000556072 GRIN2AQ12879 1464 aa22.21■■□□□ 1.15
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CLIP1P30622 1438 aa22.21■■□□□ 1.15
VASH1-AS1-202ENST00000556072 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms