Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms