Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMPOP42166 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPOP42166 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms