Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TMPRSS4Q9NRS4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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