Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms