Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASIC1P78348 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms