Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms