Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SGCZQ96LD1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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