Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM4Q9UKN5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms