Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CROTQ9UKG9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms