Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF3CQ99613 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3CQ99613 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CQ99613 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms