Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NKX2-3Q8TAU0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NKX2-3Q8TAU0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX2-3Q8TAU0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms