Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARA5Q6ZMJ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms