Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RWDD4Q6NW29 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RWDD4Q6NW29 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD4Q6NW29 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms