Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFMBT2Q5VUG0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFMBT2Q5VUG0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms