Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYTL3Q4VX76 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms