Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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NDUFA9Q16795 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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NDUFA9Q16795 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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NDUFA9Q16795 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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NDUFA9Q16795 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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NDUFA9Q16795 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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NDUFA9Q16795 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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NDUFA9Q16795 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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NDUFA9Q16795 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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NDUFA9Q16795 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFA9Q16795 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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