Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH1Q15438 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH1Q15438 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms