Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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