Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC3Q13507 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRPC3Q13507 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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