Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA4Q13439 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA4Q13439 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA4Q13439 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms