Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDE3BQ13370 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE3BQ13370 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
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