Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAF2Q12933 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF2Q12933 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms