Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DEUP1Q05D60 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms