Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.027e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.917e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.887e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.87e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.797e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.767e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-209ENST00000554709 327 ntTSL 419.32■□□□□ 0.687e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-212ENST00000638717 2118 ntTSL 519.21■□□□□ 0.677e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-214ENST00000556702 520 ntTSL 219.19■□□□□ 0.667e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.667e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 PPP1R21-203ENST00000416913 3208 ntTSL 219.12■□□□□ 0.657e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.627e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC39A9-210ENST00000557046 855 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC39A9-203ENST00000538956 1264 ntTSL 218.55■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 RCL1-205ENST00000441844 497 ntTSL 218.44■□□□□ 0.547e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-216ENST00000556979 615 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.497e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC39A9-207ENST00000555840 2377 ntTSL 217.52■□□□□ 0.399e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-206ENST00000394606 2097 ntTSL 1 (best)17.05■□□□□ 0.327e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.297e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-210ENST00000638554 3045 ntTSL 516.49■□□□□ 0.237e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-213ENST00000556443 585 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.227e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-202ENST00000284165 3155 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.127e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-217ENST00000639423 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.17e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 ATAD2-202ENST00000517666 4995 ntTSL 515.58■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.027e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SMURF2-203ENST00000578386 3104 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.017e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TACC2-208ENST00000369001 3685 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 PPP1R21-205ENST00000431614 2481 ntTSL 514.75□□□□□ -0.057e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC39A9-201ENST00000031146 5192 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 ATAD2-204ENST00000521496 3133 ntTSL 1 (best)14.58□□□□□ -0.087e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TACC2-203ENST00000358010 3815 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.167e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TNFRSF19-201ENST00000248484 3276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC39A9-202ENST00000336643 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC39A9-206ENST00000555245 1531 ntTSL 212.76□□□□□ -0.379e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TACC2-228ENST00000515273 9245 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TACC2-202ENST00000334433 9377 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.427e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TACC2-210ENST00000369005 9673 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SMURF2-202ENST00000578200 339 ntTSL 512.26□□□□□ -0.457e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TACC2-212ENST00000453444 9158 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.497e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.57e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SLC39A9-211ENST00000628474 3701 ntTSL 511.67□□□□□ -0.549e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-207ENST00000553928 623 ntTSL 1 (best)11.64□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.597e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 ATP2A2-207ENST00000548169 2951 ntTSL 211.28□□□□□ -0.67e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 UCK2-204ENST00000464197 811 ntTSL 411.02□□□□□ -0.657e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.667e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 ATP2A2-209ENST00000550248 544 ntTSL 410.71□□□□□ -0.697e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.877e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 UCK2-203ENST00000463772 599 ntTSL 59.5□□□□□ -0.897e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 UCK2-202ENST00000462329 830 ntTSL 1 (best)9.09□□□□□ -0.957e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 ATAD2-203ENST00000519124 4650 ntTSL 1 (best)8.59□□□□□ -1.037e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SMURF2-206ENST00000582081 5892 ntTSL 57.93□□□□□ -1.147e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.187e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 POLR2B-208ENST00000478188 3093 ntTSL 26.77□□□□□ -1.337e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 ATAD2-207ENST00000534257 544 ntTSL 45.81□□□□□ -1.487e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 EPM2A-228ENST00000640898 322 ntTSL 45.25□□□□□ -1.577e-8■■■■■ 30.6
HNRNPMP52272 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 318.58■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 STAM-201ENST00000377500 729 ntTSL 522.33■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 STAM-203ENST00000445846 740 ntTSL 419.05■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.835e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 CNOT3-210ENST00000618939 4516 ntTSL 518.27■□□□□ 0.525e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 ZHX2-202ENST00000534247 873 ntTSL 35.53□□□□□ -1.526e-7■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 PSMA7-205ENST00000484488 1023 ntTSL 337.54■■■■□ 3.69e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.189e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 HMBOX1-215ENST00000560599 1426 ntTSL 527.22■■□□□ 1.959e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.99e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 BRD9-214ENST00000497410 1916 ntTSL 224.74■■□□□ 1.559e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.549e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.199e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 BRD9-215ENST00000518250 689 ntTSL 322.29■■□□□ 1.169e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 SLC35E2B-202ENST00000481276 2199 ntTSL 221.5■■□□□ 1.039e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 HMBOX1-213ENST00000560269 569 ntTSL 420.72■□□□□ 0.919e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.779e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.769e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.689e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.439e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 HMBOX1-207ENST00000519662 811 ntTSL 417.1■□□□□ 0.339e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.279e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 HMBOX1-208ENST00000521516 2216 ntTSL 212.92□□□□□ -0.349e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 HMBOX1-201ENST00000287701 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.539e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 HMBOX1-214ENST00000560357 979 ntTSL 210.87□□□□□ -0.679e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.819e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.359e-9■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 AHCTF1-206ENST00000483900 3451 ntTSL 22.56□□□□□ -26e-7■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 AHCTF1-203ENST00000470300 7041 ntTSL 1 (best)1.74□□□□□ -2.136e-7■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 GYPC-206ENST00000484700 766 ntTSL 528.83■■■□□ 2.211e-8■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 ZNF75D-204ENST00000494295 1678 ntTSL 225.1■■□□□ 1.617e-7■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.451e-8■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.361e-8■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 GYPC-205ENST00000464053 1805 ntTSL 1 (best)23.09■■□□□ 1.291e-8■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 GYPC-204ENST00000459787 758 ntTSL 322.57■■□□□ 1.21e-8■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.217e-7■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 ATP11A-208ENST00000459908 4516 ntTSL 214.97□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 ATP11A-204ENST00000418678 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.8□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.622e-6■■■■■ 30.5
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 181.5 ms