Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCP20941 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCP20941 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCP20941 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCP20941 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCP20941 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCP20941 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCP20941 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCP20941 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCP20941 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCP20941 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCP20941 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCP20941 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCP20941 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCP20941 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCP20941 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCP20941 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCP20941 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCP20941 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCP20941 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCP20941 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCP20941 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCP20941 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCP20941 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCP20941 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCP20941 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCP20941 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCP20941 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCP20941 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCP20941 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCP20941 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCP20941 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCP20941 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCP20941 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCP20941 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCP20941 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCP20941 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCP20941 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCP20941 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCP20941 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCP20941 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCP20941 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCP20941 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCP20941 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCP20941 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCP20941 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCP20941 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCP20941 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCP20941 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCP20941 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCP20941 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCP20941 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCP20941 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCP20941 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCP20941 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCP20941 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCP20941 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCP20941 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCP20941 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCP20941 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCP20941 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCP20941 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCP20941 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCP20941 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCP20941 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCP20941 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCP20941 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCP20941 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCP20941 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCP20941 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCP20941 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCP20941 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCP20941 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCP20941 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCP20941 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCP20941 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCP20941 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCP20941 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCP20941 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCP20941 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCP20941 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCP20941 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms