Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD53P19397 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD53P19397 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CD53P19397 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD53P19397 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD53P19397 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD53P19397 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD53P19397 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD53P19397 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD53P19397 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD53P19397 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD53P19397 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD53P19397 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD53P19397 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD53P19397 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD53P19397 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD53P19397 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD53P19397 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD53P19397 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD53P19397 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD53P19397 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD53P19397 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD53P19397 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD53P19397 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD53P19397 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD53P19397 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD53P19397 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD53P19397 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD53P19397 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD53P19397 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD53P19397 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD53P19397 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD53P19397 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD53P19397 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD53P19397 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD53P19397 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD53P19397 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD53P19397 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD53P19397 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD53P19397 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD53P19397 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD53P19397 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD53P19397 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CD53P19397 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD53P19397 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms