Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP1P09455 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP1P09455 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP1P09455 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP1P09455 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP1P09455 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP1P09455 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP1P09455 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP1P09455 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP1P09455 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP1P09455 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP1P09455 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP1P09455 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP1P09455 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP1P09455 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP1P09455 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP1P09455 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP1P09455 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP1P09455 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP1P09455 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP1P09455 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP1P09455 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP1P09455 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP1P09455 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP1P09455 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP1P09455 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP1P09455 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP1P09455 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP1P09455 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP1P09455 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP1P09455 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP1P09455 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBP1P09455 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP1P09455 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP1P09455 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP1P09455 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP1P09455 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP1P09455 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP1P09455 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBP1P09455 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP1P09455 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP1P09455 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP1P09455 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP1P09455 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP1P09455 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP1P09455 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms