Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NOBOXO60393 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOBOXO60393 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms