Protein–RNA interactions for Protein: A6NHJ4

ZNF860, Zinc finger protein 860, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF860A6NHJ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF860A6NHJ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF860A6NHJ4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF860A6NHJ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF860A6NHJ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF860A6NHJ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF860A6NHJ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF860A6NHJ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms