Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A087X1B8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087X1B8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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