Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 VDAC1P12-201ENST00000451853 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms