Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms