Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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